Gemeentelijke opgravingen
De eerste gemeentelijke opgravingen vonden dus plaats op voormalig Warnsvelds grondgebied. De projectarcheoloog werd in zijn werkzaamheden ondersteund door de vele vrijwilligers en amateurarcheologen die reeds in zutphen en omgeving actief waren. Uiteindelijk werd dit projectmatige dienstverband in 1993 omgezet in een vast dienstverband. Inmiddels dienden zich ook de eerste grote projecten in de binnenstad aan, zoals de opgravingen tijdens de restauratie van Huize van de Kasteele (Museumhotel) en de Hof van Heeckeren (SSR). In 1994 werd in de Raadhuissteeg een tufstenen woonhuis uit de 12e eeuw ontdekt. Het grootste en meest spectaculaire onderzoek vond plaats tijdens de nieuwbouw van het stadhuis te zutphen. Gedurende negen maanden werd hier bijna 2000 jaar bewoningsgeschiedenis opgegraven. De ontdekkingen van de macabere resten van een vikingaanval en de oude Hof van Bronckhorst uit de 13e tot 16e eeuw kregen landelijke publiciteit. In 1999 waren archeologische ontdekkingen in zutphen zelfs twee maal landelijk nieuws (o.a. RTL-nieuws en NOS-journaal), namelijk de ontdekking van de oostmuur van de 11e-eeuwse keizerpalts op het plein ’s-Gravenhof en de vondst van vele duizenden fragmenten (zie ZAP 8) van gebrandschilderde ramen van de Nieuwstadskerk uit de periode ca. 1300 tot 1572.

Onderzoek oud cultuurlandschap
Het onderzoek in het oude cultuurlandschap buiten de stad werd na de eerste opgravingen in 1992-’93 structureel voortgezet. In de Ooyerhoek werden in 1995 en in 1998 tot 2000 grootschalige opgravingen verricht die het nederzettingsbeeld van de buurtschap Eme verder completeerde. Bovendien werd in 2000 samen met de Rijksdienst voor het Oudheidkundig Bodemonderzoek een unieke vindplaats van jagerskampen uit het vroeg-Mesolithicum (ca. 10.500 jaar geleden) ontdekt. Het archeologisch onderzoek in de VINEX-wijk Leesten bleef veel aandacht vragen omdat de nieuwe woonwijken van Leesten op de oude enkgronden (essenlandschap) gesitueerd werden. Enken of essen zijn op de oost-Nederlandse zandgronden de archeologische vindplaatsen bij uitstek. Op de Leestense enk (1994 – 1997) werden vooral nederzettingen uit de Brons- en Ijzertijd gevonden, evenals op de Looërenk (Leesten Oost, 2000 tot heden). Hier spitst het onderzoek zich bovendien op de boeiende ontginningsgeschiedenis van dit gebied in de middeleeuwen. Het structurele en intensieve onderzoek in dit relatief beperkte gebied heeft een heel dynamisch beeld opgeleverd van meer dan 10.000 jaar menselijke bewoning. Deze belangrijke en bijzondere onderzoeksresultaten bleven niet beperkt tot ingewikkelde rapporten maar al in 1996 kwam er een publieksvriendelijk boek uit: ‘Leesten en Eme. Archeologisch en historisch onderzoek naar verdwenen buurschappen bij zutphen’ (Kampen 1996). In 2001 kwam het vervolg op dit boek uit waarin de resultaten van de laatste zes onderzoeksjaren zijn opgenomen: ‘Leesten en Eme II. Steentijdjagers en Frankische boeren in het Laaksche Veld bij zutphen’ (zutphen 2001), geheel gefinancierd door de projectontwikkelaar VOF-Laaksche Veld (Joh.Matser projectontwikkeling en HBG-vastgoed)!.